Questão 3090596

RNA-seq mede padrões locais mas não discrimina splicing alternativo, já que os reads curtos não cobrem junções de exons com fidelidade robusta.

Northern supera RT-qPCR em sensibilidade para baixa abundância, dispensando amplificação, e fornece quantificação absoluta sem padrões externos.

RNA-seq limita-se a genes anotados, não detectando transcritos novos ou junções exóticas, devido ao viés de mapeamento ao genoma de referência.

RT-qPCR quantifica globalmente sem primers direcionados, pois o melting curve distingue todos os transcritos por picos térmicos específicos universais.

RT-qPCR requer síntese de cDNA e quantifica transcritos específicos com alta sensibilidade, mas não recupera isoformas globais sem primers/sondas desenhados a priori.