Questão 2327252

Biologia · 2024

Questão

ID 2327252

Disciplina: Biologia

Assunto: Genômica e Sequenciamento de DNA

Ano: 2024 Banca: FAURGS - Fundação de Apoio da Universidade Federal do Rio Grande do Sul Órgão: Hospital de Clínicas de Porto Alegre

Um pesquisador recebeu dados de um projeto contendo short, long e ultra-long reads advindas de sequenciamentos de genomas humanos. O primeiro objetivo do pesquisador é empregar um montador híbrido para a montagem dos genomas. Para isso, o pesquisador deve observar

Alternativa A:
que, após análise de controle de qualidade, o próximo passo no processo é a trimagem das short, long e ultra-long raw reads, usando o software Trimmomatic com valor de Phred33.
Alternativa B:
que os montadores híbridos levam em conta, para o mapeamento das long e ultra-long reads, o tamanho dos contíguos, mas não os k-mers compartilhados entre eles.
Alternativa C:
que, empregando a abordagem de montagem híbrida, utilizando exclusivamente grafos de Bruijn, ele obterá os resultados mais robustos.
Alternativa D:
que abordagens de montagem por grafos de Bruijn ou overlap-layout-consensus, ou a combinação delas, podem ser empregadas por montadores híbridos.
Alternativa E:
que, para a obtenção de resultados confiáveis, a estratégia de montagem deverá prever o processamento das short, long e ultra-long reads com valor inferior a Phred10.

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